130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1913 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  100 
 
 		 127 aa  256  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1865  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.8 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2671  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.37 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.136916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5480  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.78 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  25.93 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.85 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1361  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00653579  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.93 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  23.85 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 142 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  32.56 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  27.66 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  22.94 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  24.07 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.17 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  28.4 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.55 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  22.94 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  22.94 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  22.94 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  22.94 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  26.42 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1200  anti-sigma-factor antagonist  32.39 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  22.02 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  26.42 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  27.27 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  30.23 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  28.4 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  23.15 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.03 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  25.37 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1117  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.180588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.03 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  24.04 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  22.22 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  28.36 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1663  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  25.3 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.77 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  20.22 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1736  anti-sigma-factor antagonist  31.94 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6631  hypothetical protein  27.2 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  37.7 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.37 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.71 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.69 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  25.93 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25.97 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  23.6 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  31.94 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  27.14 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  31.17 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  31.17 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  31.17 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  31.17 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  23.4 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.27 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  24.07 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  31.17 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  30.95 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  30.95 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  31.17 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>