38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1183 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1200  anti-sigma-factor antagonist  57.35 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  56.91 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  60 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  73.95 
 
 		 130 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1361  anti-sigma-factor antagonist  50.51 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00653579  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1117  anti-sigma-factor antagonist  47.45 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.180588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 113 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 110 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  30.26 
 
 		 113 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 111 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 112 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 		 138 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1865  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.36 
 
 		 128 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  24.1 
 
 		 120 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  26.42 
 
 		 127 aa  48.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  28.95 
 
 		 113 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  28.95 
 
 		 113 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  25.93 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  26.32 
 
 		 97 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 117 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 		 110 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  26.8 
 
 		 111 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 115 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  27.84 
 
 		 111 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  23.75 
 
 		 111 aa  44.7  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  20.48 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  27.5 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 110 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  23.76 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  30.43 
 
 		 429 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  25.3 
 
 		 109 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 109 aa  41.2  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  25.71 
 
 		 111 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>