44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0958 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1200  anti-sigma-factor antagonist  64.65 
 
 		 212 aa  227  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  82.95 
 
 		 130 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  56.86 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  56.67 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1361  anti-sigma-factor antagonist  57.73 
 
 		 204 aa  187  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00653579  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1117  anti-sigma-factor antagonist  45.67 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.180588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  31.96 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 111 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1078  hypothetical protein  35.34 
 
 		 123 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 113 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  28.97 
 
 		 127 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 112 aa  48.5  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  30.99 
 
 		 110 aa  48.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 110 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 113 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 104 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 104 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 138 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1865  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.09 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  27.55 
 
 		 111 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 110 aa  45.1  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 92 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  22.45 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  32.39 
 
 		 117 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  24.77 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 111 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 115 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  28.92 
 
 		 96 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 117 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 127 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  30.65 
 
 		 429 aa  42.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 111 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  31.07 
 
 		 351 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 111 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2671  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.96 
 
 		 138 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.136916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 		 111 aa  41.2  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  29.35 
 
 		 782 aa  41.2  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  27.94 
 
 		 113 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>