47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1796 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  100 
 
 		 782 aa  1607    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  25.73 
 
 		 438 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  24.09 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 114 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  36.28 
 
 		 250 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 121 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.83 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  33.33 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 111 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.71 
 
 		 110 aa  57  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 111 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  30.51 
 
 		 269 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.21 
 
 		 112 aa  55.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.21 
 
 		 112 aa  55.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  30.1 
 
 		 116 aa  55.1  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 112 aa  54.3  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 111 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 111 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 109 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 142 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 119 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 111 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.65 
 
 		 336 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 123 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.93 
 
 		 110 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 117 aa  48.5  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 250 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  50 
 
 		 236 aa  47.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 249 aa  47.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 134 aa  47.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 110 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 112 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  30 
 
 		 99 aa  47.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 111 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.71 
 
 		 134 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.68 
 
 		 112 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 117 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  24.74 
 
 		 113 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2002  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 117 aa  45.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  26 
 
 		 112 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  28.33 
 
 		 238 aa  45.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 100 aa  45.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 123 aa  45.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 112 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 121 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  20.82 
 
 		 429 aa  44.3  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>