41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1361 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1361  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00653579  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1200  anti-sigma-factor antagonist  55.17 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1117  anti-sigma-factor antagonist  56.12 
 
 		 190 aa  191  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.180588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  75.63 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  71.2 
 
 		 198 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  50.75 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  52.73 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  31.78 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 111 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  27.52 
 
 		 111 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 113 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  24.39 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  25.61 
 
 		 120 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 111 aa  48.9  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 113 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 112 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 119 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  25.66 
 
 		 110 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2691  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  27.72 
 
 		 332 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.721322  normal  0.111915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.67 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  26.19 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  26.19 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.67 
 
 		 112 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 115 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  23.47 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  28.05 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 112 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.26 
 
 		 118 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1865  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.57 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  28.12 
 
 		 97 aa  42.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 104 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 104 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  23.21 
 
 		 142 aa  42  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 111 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  29.63 
 
 		 116 aa  41.6  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  25.51 
 
 		 111 aa  41.6  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>