229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0792 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  48.45 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  35.92 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  42.05 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1663  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1736  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.83 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  27.55 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  39.19 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  32.94 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.67 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  35.44 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  30 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  30.67 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  29.13 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  29 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  40.32 
 
 		 256 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.13 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.13 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.08 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  31.13 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  22.45 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  28.77 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  30.3 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.13 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  23.91 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.19 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.45 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  37.66 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.48 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  31.13 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  27.96 
 
 		 351 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.13 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  25.53 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0752  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.39 
 
 		 318 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  32.97 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  35.38 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2078  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.14 
 
 		 332 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000182563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  33.85 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  30.67 
 
 		 117 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 269 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  22.64 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>