273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1874 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  100 
 
 		 113 aa  226  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  63.72 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  63.72 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  63.06 
 
 		 111 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  63.06 
 
 		 111 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  62.16 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  61.26 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  56.88 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  50.93 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  42.31 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  38.74 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.04 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.64 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  34.04 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  37.08 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  38.68 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  36.45 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.64 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  41.3 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  34.74 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  32.46 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.65 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  39.76 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  33.33 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  32.14 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.04 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  41.1 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.43 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.3 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  30.97 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  30.56 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.88 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  27.78 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.21 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  25.89 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  24.11 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.55 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  31.96 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  29.63 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>