161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4051 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 
115 aa  229  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  55.14 
 
 
114 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  49.55 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  53.26 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  51.52 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  54.02 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  54.02 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  44.33 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  33.04 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  41.28 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  35.64 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  38.38 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
120 aa  59.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.67 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  37 
 
 
351 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
102 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 
110 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  37.31 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 
110 aa  52  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3127  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  31.63 
 
 
120 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  38.46 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.14 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 
249 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  37.5 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 
250 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.92 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.05 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.98 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  38.27 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.59 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  37.29 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  27.03 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.43 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  28.57 
 
 
108 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 
117 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 
117 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 
112 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2078  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.94 
 
 
332 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000182563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  38.55 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.52 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  35.94 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  35.94 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.59 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  36.51 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  27 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  27.55 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  27.55 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  36.71 
 
 
269 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.18 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003528  anti-anti-sigma regulatory factor  36.84 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  32.74 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  25.93 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>