214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1015 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 107 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  59.05 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  56.19 
 
 		 115 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  46.23 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.63 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.28 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  28.44 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  32.11 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  33.03 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  39.51 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  33.64 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.71 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  35.24 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.99 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  31.13 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.99 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  37.36 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.88 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.47 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.57 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.11 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.21 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.21 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  32.35 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  27.52 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  38.33 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  27.45 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.29 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  22.64 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  29 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>