256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2833 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  100 
 
 
111 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  63.3 
 
 
109 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  59.09 
 
 
113 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  59.09 
 
 
113 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  59.09 
 
 
113 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  53.92 
 
 
117 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  59.14 
 
 
110 aa  103  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  51.85 
 
 
110 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  50.98 
 
 
117 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  49.07 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  48.18 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.21 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  40.21 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  36.73 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  33.65 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  39.56 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  35.05 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  40.86 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.41 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1736  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1663  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  44.05 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  41.46 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 
113 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  36 
 
 
351 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  37.78 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  39.76 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  39.33 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 
118 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.02 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  38.68 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 
112 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33.93 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  38.55 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.17 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.31 
 
 
336 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  35.23 
 
 
350 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2078  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.31 
 
 
332 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000182563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  28.72 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  37.97 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  36.26 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  27.5 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
116 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>