242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2616 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 111 aa  212  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  48.62 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  53.92 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  53.92 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  53.92 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  50.93 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  48.04 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  48.04 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  49.07 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  46.73 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  47.22 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.71 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  39.33 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.14 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  45.21 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.69 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  30.91 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  32.41 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.86 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.82 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  41.3 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  33.68 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  38.61 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.64 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  48.48 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  34.83 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  29.09 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  29.09 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  34.02 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  24.07 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  34.83 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.9 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  39.02 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.44 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  35.62 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21.65 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.02 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.71 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  37.36 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.09 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.03 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  36.23 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  39.6 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>