235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4580 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 122 aa  254  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  81.67 
 
 		 142 aa  203  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  85.96 
 
 		 127 aa  200  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  36.73 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.08 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  33.64 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  36.19 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  36.45 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30.84 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.69 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  40.48 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  31.78 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.14 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 250 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  41.67 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  31.13 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.7 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  29.09 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  29.52 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  24.55 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.18 
 
 		 336 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.01 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 250 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>