73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3890 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 113 aa  233  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.78 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.79 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  32 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  32.69 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  34 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.18 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  29.52 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.18 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  29.17 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  23.71 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  27.55 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.86 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  31.58 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  33.78 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  22.58 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 122 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.23 
 
 		 110 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.68 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  30.21 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>