More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0483 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 122 aa  243  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  77.48 
 
 		 113 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  75 
 
 		 113 aa  173  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  73.21 
 
 		 113 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  73.87 
 
 		 113 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  66.96 
 
 		 112 aa  159  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  67.24 
 
 		 117 aa  154  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  67.54 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  67.26 
 
 		 116 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  67.89 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  66.67 
 
 		 116 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  58.18 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  61.9 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  58.56 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  47.37 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  44.86 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  49.14 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  42.06 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  43.93 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  43.36 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  37.5 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  45.19 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  34.31 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  35.29 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.31 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  39.08 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.31 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  34.31 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.33 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.33 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.33 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  34.51 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  32.46 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  34.95 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.78 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  41.84 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  39.09 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  35.92 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  36.36 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  40.82 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  39.18 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.55 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.33 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.25 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.38 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  30.21 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  27.08 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.4 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  39.05 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  31.13 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>