200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2671 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 119 aa  229  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  40.66 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  43.96 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  38.89 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  41.11 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  40.66 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  40.23 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  37.74 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  38.32 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  45.45 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  39.56 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  38.32 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  42.22 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  40.66 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.7 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  43.48 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  42.16 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.89 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  48.48 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.04 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  41.46 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.22 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  37.96 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  35.11 
 
 		 505 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  36.54 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.76 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  30.19 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  30.19 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.48 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.1 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  36.08 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  30.68 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  30.88 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  32.39 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0427  anti-anti-sigma factor  40 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.51 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  38.03 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  26.53 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  31.87 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  41.82 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  43.08 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  41.18 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.4 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>