67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4611 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  28.97 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  29.52 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  30.53 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.38 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  36.49 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30.21 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 249 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  33.77 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  29.25 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  25.53 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 107 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  23.58 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  22.52 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  32.81 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.24 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  23.15 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0427  anti-anti-sigma factor  27.1 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  24.1 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.35 
 
 		 332 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  30.99 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.35 
 
 		 332 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.8 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.09 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4094  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 111 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.05 
 
 		 150 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  24.74 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  23.58 
 
 		 123 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  23.64 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  28.99 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  26.25 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  25.3 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  25.3 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 110 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>