111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2418 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4094  anti-sigma-factor antagonist  54.64 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.3 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  28.28 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.72 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  30.84 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  25.44 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30.28 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  24.3 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31.13 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  27.78 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.61 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  24.56 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  27.52 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.24 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  25.26 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.9 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2002  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.47 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.1 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  22.02 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  22.58 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  22.86 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  32.86 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  25 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  23.66 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  27.27 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  22.64 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  24.71 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  24.32 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  22.94 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  24.44 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  24.44 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  23.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.74 
 
 		 112 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  24.44 
 
 		 113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 		 117 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 		 117 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.74 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  20.79 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3127  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  23.96 
 
 		 351 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>