164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5092 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 108 aa  211  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 		 250 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.64 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  39.64 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  38.74 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  33.67 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  39.25 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  39.58 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  37.96 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  37.84 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  39.6 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  35.45 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  29.81 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  29.81 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  38.74 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41.59 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  41.51 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  34.23 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  34.55 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.23 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  36.19 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21.5 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  34.51 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  32.11 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  33.91 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  22.43 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  30.91 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.46 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 250 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  31.43 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.78 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.68 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  31.31 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  22.97 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>