92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3434 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
114 aa  220  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  40.59 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  39.56 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.51 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  41 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  35.87 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0867  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.157195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.99 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  41.46 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  22.83 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 
108 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.69 
 
 
113 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  32.94 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.47 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 
846 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.61 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  33.68 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 
170 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  33.67 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  31.31 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  36.36 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.85 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.48 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  34.69 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  37.66 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  23.4 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.47 
 
 
114 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  33.33 
 
 
118 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 
114 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  30.77 
 
 
114 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
115 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
166 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.11 
 
 
113 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  40.79 
 
 
203 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  35.53 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  25.25 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  24.68 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  30.59 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  38.16 
 
 
111 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  24.74 
 
 
111 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>