147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0252 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 114 aa  224  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  57.89 
 
 		 114 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  37.72 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.82 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  30.48 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  30.48 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.41 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  23.58 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.48 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  26.42 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.65 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  41.94 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  31.53 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  42.5 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.97 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  25.74 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  33.33 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.84 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  40.96 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.39 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  24 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  22.45 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  27.88 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  32.35 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.79 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.68 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  28.12 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  38.46 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  36 
 
 		 653 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  43.9 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2769  anti-sigma-factor antagonist  43.1 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.01 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0915  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 243 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  31.94 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.43 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>