109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1279 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  45.65 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  45.65 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  40.78 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  46.46 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.62 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.69 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.73 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  46.03 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  48.44 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  45.45 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  40.23 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  43.75 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  45.9 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  40.3 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  39.02 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.88 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.97 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  32.58 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  31.58 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  43.86 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.96 
 
 		 112 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.59 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  30.34 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  26.53 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2691  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.76 
 
 		 332 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.721322  normal  0.111915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  34.15 
 
 		 350 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  36.05 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  33.9 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  35.37 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.47 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  40.98 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.47 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  31.43 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  30.12 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0876  hypothetical protein  26.67 
 
 		 93 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.29 
 
 		 151 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  31.75 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>