190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2906 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  89.72 
 
 		 115 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  88.79 
 
 		 107 aa  183  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  57.01 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  56.07 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  52.58 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  51.52 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  42.59 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  42 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  39.81 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  42 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  39.81 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  41.67 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  38.3 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  43.88 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  35.19 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.18 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  36.54 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  35.14 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.01 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  41.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.48 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  31.48 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  43.55 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  30.69 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.78 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  30.28 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  32.93 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36.26 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.23 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  31.48 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 110 aa  48.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  47.27 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  38.81 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.73 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  35.37 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  27.16 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3127  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  34.07 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  29.55 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.56 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.58 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  45.45 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>