117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0663 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 117 aa  236  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 117 aa  236  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  54.46 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  45.65 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.48 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.38 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.41 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.96 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  41.27 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  41.43 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  42.65 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  45.9 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.65 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  26.85 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  47.37 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  34.85 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  31 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0427  anti-anti-sigma factor  38.33 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  39.71 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  27.18 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  31.91 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.26 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  24.51 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  37.7 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  21.74 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.31 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  29.27 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  31.91 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  28.17 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.91 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  31.03 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  36.21 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  26.76 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  21.88 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.67 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  19.19 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  39.66 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  19.19 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  19.19 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 111 aa  42  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  21.57 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  24.18 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  24.42 
 
 		 111 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>