162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1765 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 113 aa  223  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  59.29 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  44.25 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.38 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  33.72 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  33.64 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  29.52 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  31.18 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  37.8 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  29.9 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  30.1 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25.44 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  29.03 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.89 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.39 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.42 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  32.05 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  27.27 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2816  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0655921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  28.99 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  34.18 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  26 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  27.88 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  25.93 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  30.95 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.19 
 
 		 350 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.71 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  24.1 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  23.58 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3391  anti-anti-sigma factor  30.68 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  27.83 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  32.91 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  26.05 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  33.78 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.21 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  29.49 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  23.96 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  32.89 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  24.64 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0427  anti-anti-sigma factor  30.12 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  24.07 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>