52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3391 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3391  anti-anti-sigma factor  100 
 
 		 120 aa  236  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  94.17 
 
 		 120 aa  224  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  34.92 
 
 		 127 aa  48.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.49 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  38.96 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  38.96 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  34.09 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.87 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  21.51 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 121 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  29.17 
 
 		 111 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  24.14 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  32.61 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  21.3 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  40.68 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.71 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.97 
 
 		 126 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 117 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  20.69 
 
 		 110 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 118 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>