109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5145 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 115 aa  226  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3391  anti-anti-sigma factor  30.28 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.89 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  32.08 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.58 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.63 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.58 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.58 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.58 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  27.45 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.67 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.53 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  23.4 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.53 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  29.47 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  30.49 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  30.49 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  37.21 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  29.41 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  30.14 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  29.87 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  31.58 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  28.43 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.08 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  26.19 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  28.16 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  20.2 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.77 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  28.24 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  22.92 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  22.12 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.07 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  27.66 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  32.29 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  29.58 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.56 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  23.4 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  31.25 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  30.68 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.84 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  29.9 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  30.99 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  29.63 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  41.82 
 
 		 846 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21.74 
 
 		 111 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 115 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 114 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 136 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.73 
 
 		 150 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 109 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.17 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02233  hypothetical protein  25 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>