63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0632 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  100 
 
 
107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.04 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  31.58 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  29.87 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  23.71 
 
 
101 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 
102 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  27.16 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.17 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.17 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.42 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  25.56 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  21.88 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  27.38 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  26 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 
154 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.49 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.58 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.47 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  25.27 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  31.67 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.58 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.14 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  24.42 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  24.42 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 
130 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  30.88 
 
 
113 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 
113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  32.76 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 
113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  25.29 
 
 
101 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.49 
 
 
112 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.49 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  31.75 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  25.56 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  23.66 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  22.83 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  24.47 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>