147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3398 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  77.88 
 
 		 115 aa  163  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  68.42 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  65.09 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  54.72 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  48.21 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  41.35 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  42.27 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  41.24 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  41.24 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  33.04 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.26 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.09 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  34.38 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33.68 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  38.24 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.85 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.67 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.4 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.28 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  32.98 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  26.53 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  24.42 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  24.44 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  34.55 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.63 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  25.66 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.63 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.53 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  28.12 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1237  anti-sigma-factor antagonist  37.7 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  38.16 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  35.9 
 
 		 505 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  32.18 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  24.69 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  24.68 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13130  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  28.92 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.23 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  25.23 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  27.55 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  38.6 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.53 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  35.29 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3679  hypothetical protein  34.02 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 436 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>