79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1237 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1237  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3806  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0167156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  41.07 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.43 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.36 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.36 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.63 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.33 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  30.48 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  37 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  32.69 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  26.8 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  33.9 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  30.77 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5015  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  32 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.29 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.84 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 436 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  28.42 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  38.98 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  25.89 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.66 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.27 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  34.62 
 
 		 505 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.39 
 
 		 118 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  27.55 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  26.03 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  30 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 118 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 123 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  30.39 
 
 		 162 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 115 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 141 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>