41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3533 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.5 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  40.4 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  47.5 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  41.86 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  42.35 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  43.53 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  40.48 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  46.84 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.96 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.79 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  45.57 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.04 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.94 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0278  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  35.44 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  30.93 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  39.29 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  30.39 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  42.37 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  30.53 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.15 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.77 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 117 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  29.51 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  25 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>