71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  83.17 
 
 		 101 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  83.17 
 
 		 101 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  84 
 
 		 101 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  66.34 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  66.34 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  65.35 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  64.36 
 
 		 101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  63.11 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  62.14 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  63 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  57.43 
 
 		 99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  55.45 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  53 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  56.32 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  45.71 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41 
 
 		 100 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  46.07 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  44.32 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  37 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  34 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  38.3 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  45.57 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  37.08 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.56 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  36.26 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  26.53 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 250 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  33.33 
 
 		 94 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1771  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.18 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2188  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.61 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 249 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  31.25 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  31.25 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.47 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1602  hypothetical protein  29.11 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  31.25 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  21.59 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  30.49 
 
 		 568 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  31.4 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  28.74 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  20 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0278  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  32.26 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 250 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 107 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4611  sulphate transporter  30.12 
 
 		 493 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2198  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2743  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  26.42 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  28.81 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1315  sulphate transporter  31.33 
 
 		 520 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 119 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>