89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0156 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  100 
 
 		 99 aa  203  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  42.86 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  42.57 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  42 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  38.38 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  36.54 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  39.6 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.27 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  34 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  36.78 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  29.7 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.09 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  32.47 
 
 		 350 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.03 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  35.09 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  23.76 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  39.66 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.74 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  24.51 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.41 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.72 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  28.12 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 99 aa  43.9  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  30.56 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  24.21 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  39.62 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  30.51 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  42.37 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 102 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  28.41 
 
 		 151 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.55 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  32.31 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  31.75 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  32.73 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  32.76 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  32.76 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  35.09 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 127 aa  40.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.66 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 250 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  28.38 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.66 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  22.77 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2188  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  23.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  29.31 
 
 		 111 aa  40  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  32.26 
 
 		 351 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>