90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01716 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  100 
 
 		 101 aa  205  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  55 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  44.55 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  44.55 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  42.57 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  41 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  39 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  39 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  39 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.22 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  37 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  38 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  30.11 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 100 aa  52  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  31.82 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  30.11 
 
 		 351 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  32.58 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  32.58 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  32.61 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  31.68 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  32.58 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.29 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  25 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.03 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  28.4 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  35.94 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  25.24 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  26.73 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.81 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  35.59 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  35.59 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2767  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314327  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.68 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.74 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  31.82 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  31.25 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  26.09 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  22.77 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  28.89 
 
 		 336 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  25.32 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  23.76 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  29.27 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.93 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  27.69 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003528  anti-anti-sigma regulatory factor  27.45 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  33.9 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  26.25 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2188  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  25.3 
 
 		 120 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  25.26 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  25.76 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.36 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.94 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2687  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  21.78 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  25.96 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  33.77 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  31.75 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>