51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2687 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2687  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0867  anti-sigma-factor antagonist  46.94 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.157195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.67 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.88 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  31.17 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  32.84 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  28.21 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  24.74 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  29.85 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.05 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  29.49 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  26.14 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  31.08 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  30.88 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  32.05 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  27.54 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  25.26 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30.26 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 107 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.18 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2767  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 140 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314327  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  31.75 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  24.24 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.77 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  24.14 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  29.03 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  22.22 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.34 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  24.66 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2769  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  25.3 
 
 		 111 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>