174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4411 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  76.8 
 
 		 132 aa  192  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  77.24 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  75.68 
 
 		 114 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  76.79 
 
 		 116 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  76.79 
 
 		 116 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  84.04 
 
 		 93 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  50.41 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  48.74 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  73.53 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  47.83 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  44.25 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  40.4 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  42.55 
 
 		 99 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26.55 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.67 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  28 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  31.3 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  34.52 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  40.58 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  34.09 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.63 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  32.97 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  26.32 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  24.32 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36.51 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  38.16 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  25 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36.51 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36.17 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  30.93 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  26.44 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.07 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.17 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.44 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  33.68 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  30.67 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.44 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  29.17 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  25.53 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  33.82 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>