105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1153 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  83.59 
 
 		 128 aa  221  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  77.97 
 
 		 118 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  70.43 
 
 		 115 aa  170  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  67.68 
 
 		 99 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  66.67 
 
 		 99 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  55 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  48.74 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  50.86 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  47.66 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  47.66 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  58.46 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  30.34 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 436 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  29.13 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.55 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  27.55 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.55 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  28.89 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.55 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.55 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  32.39 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  36.07 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.41 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 846 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  26.89 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  30.43 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003528  anti-anti-sigma regulatory factor  36.92 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  39.68 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02233  hypothetical protein  32.88 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  31.58 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.55 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  32.47 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  32.86 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  23.3 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  29.63 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.51 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  22.68 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.55 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  29.58 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.79 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  41.82 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  24.04 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0047  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  22.68 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  32.84 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 115 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 115 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 115 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 115 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 112 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  34.78 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 122 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  31.08 
 
 		 138 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 122 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  36.21 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>