168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2424 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  80.17 
 
 		 132 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  76.79 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  71.96 
 
 		 114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  71.03 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  68.48 
 
 		 93 aa  127  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  46.43 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  47.66 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  44.14 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  71.88 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  48.39 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  47.31 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  42.99 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26.72 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  26.72 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.04 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.53 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  34.83 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  31.43 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.85 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.09 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  37.08 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1663  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1736  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.34 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  44.12 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  22.64 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  23.08 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  32.69 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  33.02 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  34.48 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  31.52 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  22.43 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 250 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  27.88 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  27.71 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>