181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1663 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
111 aa  219  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  45.95 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  46.73 
 
 
111 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  39.42 
 
 
113 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  42.45 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  42.45 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 
116 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  44.66 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  37.86 
 
 
116 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  40.43 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.98 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.96 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  30.61 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.11 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.42 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  23.3 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  26 
 
 
429 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.7 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  30.17 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  20.56 
 
 
118 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  30.23 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  32.93 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  31.25 
 
 
122 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 
111 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 
117 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  33.72 
 
 
332 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  33.72 
 
 
332 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  22.52 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  27.36 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  23 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  26.17 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.87 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  32.95 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  20.91 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.13 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  24.47 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.53 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  24.04 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1663  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  22.43 
 
 
142 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 
117 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.49 
 
 
115 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.75 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>