219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1178 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  43.12 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  45.37 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  40.19 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  38.53 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  45.88 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  39.62 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  40 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.51 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  40 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.84 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  37.96 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  35.64 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  31.58 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  32.11 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.09 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.78 
 
 		 437 aa  63.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  29.36 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.63 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  29.09 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.71 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  37.63 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.96 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 113 aa  57  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  30 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  30.93 
 
 		 429 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.25 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  25.53 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  23.76 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  24.77 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  29.63 
 
 		 782 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  30.21 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.59 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  25.26 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>