More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0872 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  49.55 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  47.75 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  46.09 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  49.49 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  47.75 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  47.75 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  44.74 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  42.11 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  47.62 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  43.24 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  46.94 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  48.81 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  47.13 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  40.18 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  33.7 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  39.58 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.69 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.7 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33.93 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.7 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.7 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.61 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  32.61 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36.94 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.61 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  33.03 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 250 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.61 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  35.58 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  35.58 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.77 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  34.29 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  41.82 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  29.63 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  33.05 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  39.33 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  36.26 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.04 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  33.02 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.66 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  38.32 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  35.16 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  31.3 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  34.95 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  31.53 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  31.53 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>