97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13718 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  100 
 
 		 122 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  41.05 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  43.96 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  40.21 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  42.7 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  41.57 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  43.02 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  31.62 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  34.31 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  32.76 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  31.82 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  30.51 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  32.11 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.04 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  41.54 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  40.3 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  26.32 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.13 
 
 		 437 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.97 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  42.37 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5015  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  38.33 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  37.68 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  35.37 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34950  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  31.03 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0660877  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  30.33 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  28.57 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.68 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  30.53 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  34.67 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  28.1 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 405 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  37 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  29.85 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 120 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 120 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2807  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 155 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.32 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  28.36 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  29.85 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  24.55 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  27.84 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  25.89 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 		 340 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  20.62 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  23.01 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  31.34 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  31.68 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  31.68 
 
 		 160 aa  40  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1316  anti-sigma-factor antagonist  36.92 
 
 		 111 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4774  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 98 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>