23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2360 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  98.12 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32710  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  90.62 
 
 		 160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1683  anti-sigma-factor antagonist  88.68 
 
 		 160 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1707  anti-sigma-factor antagonist  88.05 
 
 		 160 aa  295  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3576  anti-sigma-factor antagonist  87.42 
 
 		 160 aa  292  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00186443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2166  anti-sigma-factor antagonist  86.79 
 
 		 160 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1930  anti-sigma-factor antagonist  86.88 
 
 		 164 aa  286  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.109032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3848  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  86.25 
 
 		 160 aa  286  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2118  anti-anti-sigma factor, putative  85.62 
 
 		 161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.430881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1913  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  85.62 
 
 		 161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1478  anti-sigma-factor antagonist  54.43 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1113  hypothetical protein  47.53 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1473  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  41.25 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.196106  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1607  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.38 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.93 
 
 		 602 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1079  hypothetical protein  29.56 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0259  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  25.32 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000300496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.93 
 
 		 566 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2686  anti-sigma-factor antagonist  29.06 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  28.43 
 
 		 117 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 112 aa  41.2  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>