19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1079 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1079  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  4e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0259  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.59 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000300496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32710  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  27.27 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  29.56 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  29.49 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2166  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2686  anti-sigma-factor antagonist  23.12 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3848  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  26.54 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1930  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.109032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3576  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00186443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1707  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1683  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1113  hypothetical protein  25.85 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1913  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.63 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2118  anti-anti-sigma factor, putative  27.63 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.430881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1473  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.35 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.196106  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1122  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.39 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1607  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  24.05 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1478  anti-sigma-factor antagonist  26.75 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>