25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1607 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1607  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 170 aa  347  5e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1930  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.109032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3848  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  35.22 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  34.38 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32710  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  35 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  34.59 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1478  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2118  anti-anti-sigma factor, putative  34.78 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.430881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1913  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.78 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1113  hypothetical protein  37.35 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1683  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1707  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3576  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 160 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00186443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2166  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1473  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.43 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.196106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.49 
 
 		 602 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0259  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.09 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000300496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1079  hypothetical protein  24.05 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1122  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.24 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  26.89 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 102 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 117 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 110 aa  41.2  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>