22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1913 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2118  anti-anti-sigma factor, putative  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.430881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1913  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1707  anti-sigma-factor antagonist  91.14 
 
 		 160 aa  293  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1683  anti-sigma-factor antagonist  91.14 
 
 		 160 aa  292  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1930  anti-sigma-factor antagonist  91.77 
 
 		 164 aa  292  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.109032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3848  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  90.51 
 
 		 160 aa  290  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3576  anti-sigma-factor antagonist  90.51 
 
 		 160 aa  289  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00186443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2166  anti-sigma-factor antagonist  89.87 
 
 		 160 aa  288  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32710  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  87.5 
 
 		 160 aa  287  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  85.62 
 
 		 160 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  85.44 
 
 		 160 aa  279  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1478  anti-sigma-factor antagonist  53.16 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1473  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.48 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.196106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1113  hypothetical protein  44.05 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1607  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.78 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0259  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.92 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000300496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1079  hypothetical protein  27.63 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.93 
 
 		 602 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.36 
 
 		 566 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2686  anti-sigma-factor antagonist  29.31 
 
 		 170 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 110 aa  41.6  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 112 aa  41.2  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>