19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1930 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1930  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.109032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3848  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  91.25 
 
 		 160 aa  299  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1707  anti-sigma-factor antagonist  91.82 
 
 		 160 aa  295  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1683  anti-sigma-factor antagonist  91.19 
 
 		 160 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2118  anti-anti-sigma factor, putative  91.77 
 
 		 161 aa  292  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.430881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1913  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  91.77 
 
 		 161 aa  292  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32710  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  89.38 
 
 		 160 aa  292  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3576  anti-sigma-factor antagonist  91.19 
 
 		 160 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00186443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2166  anti-sigma-factor antagonist  90.57 
 
 		 160 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  87.5 
 
 		 160 aa  287  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  86.88 
 
 		 160 aa  286  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1478  anti-sigma-factor antagonist  50.63 
 
 		 163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1113  hypothetical protein  45.68 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1473  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.41 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.196106  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1607  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.85 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0259  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.11 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000300496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1079  hypothetical protein  27.1 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.44 
 
 		 602 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.18 
 
 		 566 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>