20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0259 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0259  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 
161 aa  321  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000300496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1079  hypothetical protein  43.59 
 
 
158 aa  117  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1122  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  27.54 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2686  anti-sigma-factor antagonist  25.16 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32710  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  27.92 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1113  hypothetical protein  27.4 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1930  anti-sigma-factor antagonist  26.11 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.109032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3848  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  26.75 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1478  anti-sigma-factor antagonist  27.39 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3576  anti-sigma-factor antagonist  28.48 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00186443  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1707  anti-sigma-factor antagonist  28.48 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1683  anti-sigma-factor antagonist  28.48 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2166  anti-sigma-factor antagonist  28.48 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1913  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.92 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2118  anti-anti-sigma factor, putative  26.92 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.430881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  25.32 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  25.32 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1607  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  26.09 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  21.52 
 
 
566 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1473  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.29 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.196106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>