19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2686 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2686  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
170 aa  350  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1122  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.81 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0259  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  25.16 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000300496  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1079  hypothetical protein  23.12 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.21 
 
 
602 aa  50.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32710  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  29.06 
 
 
160 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2360  hypothetical protein  29.06 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27950  hypothetical protein  29.57 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3576  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
160 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00186443  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1707  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2166  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
160 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1683  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
160 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 
110 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 
116 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1113  hypothetical protein  23.08 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
100 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1913  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.31 
 
 
161 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2118  anti-anti-sigma factor, putative  29.31 
 
 
161 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.430881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
116 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>