284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0372 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  78.45 
 
 
116 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  70.69 
 
 
116 aa  175  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  46.36 
 
 
112 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  41.44 
 
 
120 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  39.64 
 
 
114 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  45.87 
 
 
111 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  45.87 
 
 
111 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  43.4 
 
 
112 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  41.84 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 
127 aa  93.2  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  43.81 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  39.05 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 
111 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.29 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  35.85 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.79 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.91 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.91 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  33.96 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.91 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  35.85 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.96 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.91 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  33.62 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  34.19 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  39.78 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.7 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  30 
 
 
117 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.72 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  32.35 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  31 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  37.78 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 
250 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  32.35 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.71 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.45 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  32.99 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  26.55 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.26 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  35.11 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  33.33 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  35.56 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>