37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2807 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2807  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 155 aa  294  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  35.2 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  39.45 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  51.02 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  46.67 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  41.56 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  30.63 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  39.18 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  41.57 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  33.64 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 114 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.91 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  20.95 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  33.05 
 
 		 340 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 113 aa  40.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>